עם הודעת פיקוד העורף על הסרת כל המגבלות, חוזרת גם מערכת הבריאות לשגרה. בתי החולים וקופות החולים חוזרים לפעילות רגילה והמחלקות השונות שהורדו למתחמים תת-קרקעיים יוחזרו בהדרגה בימים הקרובים לבניינים עצמם. קופות החולים הודיעו שכל מרפאות הרופאים, המעבדות, המכונים ובתי המרקחת יפעלו באופן שגרתי.
משרד הבריאות הנחה את כל בתי החולים, קופות החולים, תחנות טיפות חלב, לשכות הבריאות ושאר מוסדות המערכת לשוב לפעילות מלאה, בהתאם לעדכון הנחיות ההתגוננות. גורמי מערכת הבריאות ימשיכו להעניק מענה רפואי מלא לצורכיהם של המפונים מבתיהם, לפצועים ולכל מי שזקוק לסיוע – בבתי החולים, במלונות ובקהילה.
שר הבריאות, אוריאל בוסו, ביקש למסור הערכה ותודה למערכת הבריאות כולה, "בזכות ההיערכות והתרגול ניצלו חיי אדם ונשמר החוסן האזרחי. שוב הוכח: מערכת הבריאות של ישראל היא חזקה, איכותית ומהווה עוגן מרכזי בביטחון הלאומי והחברתי של המדינה".
מנכ"ל משרד הבריאות, משה בר סימן טוב, הוסיף: "במהלך מבצע 'עם כלביא', מערכת הבריאות פעלה תחת אש, במציאות חדשה ולא מוכרת – והמשיכה לספק מענה מקצועי, מרשים ומעורר הערכה. זו מערכת מצוינת, שפועלת יום ולילה כדי לממש את ייעודה המרכזי: הצלת חיים, הפחתת סבל ושיפור איכות חיים. המערכת התארגנה במהירות להתאים עצמה למתאר הפעילות החדש ולשמור על רציפות תפקודית".
האתגר המשמעותי ביותר נותר הפגיעה הישירה שספג בית החולים סורוקה, מרכז העל היחיד בדרום הארץ. על אף שנמנעה פגיעה בנפש, הפגיעה בתשתיות בית החולים משמעותית מאוד. בית החולים התחיל לחזור לכשירות ולתפקוד באופן מיידי, "אך אנו מחוייבים לכך שבית החולים לא רק ישוקם אלא יצמח ויתעצם כתוצאה מהפגיעה שנגרמה", אמר בר סימן טוב.
סורוקה מסר כי "פעילות בית החולים מתחדשת בהדרגה, ובהתאם אנו נערכים לחזור לאתרי בית החולים שלא נפגעו, בהדרגה. הודעות פרטניות נמסרות למטופלים שמוזמנים להגיע". עוד נמסר כי "המרכז הרפואי החל כבר בתהליכי שיקום המבנים והתשתיות, לטווח הקצר והארוך. כל חדרי המיון, חדר הלידה וחדרי הניתוח ממשיכים בפעילותם. כדי לאפשר את המשך פעילותו התקינה של המרכז הרפואי – אנו מבקשים להימנע מהגעה לא הכרחית ולצמצם ביקורים ככל האפשר".
המרכז הרפואי איכילוב הודיע שהחל בתהליך החזרת כל המטופלים למחלקות האשפוז המקוריות מעל לפני הקרקע. בית החולים שטיפל ב-320 פצועים ממטחי הטילים יחזיר את המטופלים למחלקות הרגילות בהדרגה עד ליום שישי, "כדי להבטיח את חזרתן של כל המחלקות למקומן תוך שמירה על בטיחות ועל איכות הטיפול".