שר המשפטים יריב לוין ביקש מבג"ץ לדחות את ישיבת הוועדה לבחירת שופטים, שבה היא אמורה לבחור נשיא לבית המשפט העליון, "עד שיתבררו הטענות נגד השופט יצחק עמית". לוין ציין במכתבו כי "מאז שנדחתה ישיבת הוועדה, נוספו פרסומים על השופט עמית. כינוס הוועדה מבלי שהפרסומים ייבדקו הוא בבחינת הפרת אמונו של הציבור". ישיבת הוועדה נדחתה לאחרונה לאחר חשיפת ynet ו"ידיעות אחרונות", שלפיה השופט עמית היה מעורב בניגוד עניינים לכאורה.
מדובר בפרק נוסף בעימות בין לוין לעמית והרשות השופטת, בצל התנגדותו של השר לכנס את הוועדה לבחירת שופטים ולמנות את נשיא העליון הבא לפי שיטת הסניוריטי, לה הוא מתנגד. הבוקר תקף עמית את לוין והאשים אותו כי "לאחרונה מתנהל נגדי מסע הכפשות מאורגן ומתוזמן לקראת הדיון בוועדה לבחירת שופטים לבחירת נשיא לבית המשפט העליון. במסגרת מסע זה לא נותרה אבן אחת שלא נהפכה במטרה לייצר דה-לגיטימציה ונרטיב כוזב, וזאת במטרה לסכל את מועמדותי לכהונת נשיא של בית המשפט העליון".
המועמד לנשיא העליון כתב לשר המשפטים כי "גם ללא אותו 'צבר פרסומים', אתה נמנע ממינוי נשיא לבית המשפט העליון זה כשנה ורבע, באופן חסר תקדים במדינת ישראל. זהו עוד ניסיון להימנע ממינויי כנשיא של קבע לבית המשפט העליון, רק מפני שלא הסכמתי לדון ב'דיל' שהצעת לי – הסכמה למינוי שלי תמורת מינוי מועמדים מטעמך לבית המשפט העליון.
"כמי שעומד כיום בראש הרשות השופטת כממלא מקום נשיא בית המשפט העליון, בשל התעקשותך זה כשנה ורבע שלא לכנס את הוועדה כדי למנות נשיא של קבע לבית המשפט העליון, חובתי כלפי הציבור בישראל להבטיח שירות משפטי איכותי, רציף, הוגן ויעיל לכל הציבור, וכך אני עושה מאז כניסתי לתפקיד. זאת, על אף היעדר דיאלוג ושיתוף פעולה מצידך, וניסיונות לחתור תחת החוסן של הרשות השופטת ולהחלישה". עמית הדגיש כי "מועמדותי בעינה עומדת ואין לי כל כוונה להשהות ביוזמתי את מועמדותי".
במכתב נוסף שהעביר עמית, על רקע פרסום שלפיו ביצע לכאורה עבירות בנייה בביתו, הוא הדגיש לשר המשפטים יריב לוין כי אין ממש בהאשמה. לדבריו, מדובר ב-15 מ"ר בגג ביתו, ולא נעשו בהם עבירות. "דומה כי גם ההסתייגות הנוגעת לביתי הפרטי הוגשה במסגרת 'קמפיין' מאורגן ומתוזמן", קבע עמית במכתב, ופירט כי "ברור שאין בסוג או באופן הקירוי כדי ליצור 'עבירת שימוש' בשטח של כ-15 מ"ר שהיה בנוי בעבר, הוכשר ביוזמתנו, שולם בגינו היטל השבחה וניתן לגביו היתר כדין".
לוין השיב לו וכתב במכתב נוסף לממלא מקום נשיא העליון כי "טענתך היא כי שורה של כתבים בכירים וכלי תקשורת מרכזיים, כולם חברו יחד לפעולה מאורגנת על מנת להכפיש את שמך. מדובר בטענה שכמוה לא נשמעה מפי שופט במעמדך והיא חמורה ביותר בשים לב לעובדה שאנחנו נמצאים בשיאו של הליך בחירה למשרה הרמה של נשיא בית המשפט העליון. איני מעלה על דעתי כי שופט מנוסה ובעל ניסיון ומעמד יעלה האשמה כזו מבלי שיש בידיו ראיות המבססות האשמה כה חמורה. לפי כך, הינני סבור שמחובתך, לאחר שהופצה בשמך הודעה כאמור לכלל כלי התקשורת, להביא באופן מיידי את כלל הראיות שיש ברשותך, והתומכות בהאשמה חמורה זו".
הוא התייחס לטענת עמית כי אינו מתכוון להיכנע. "לא ברורה לי אמירתך כאילו אין בכוונתך 'להיכנע' . איש אינו מנסה להכניע אותך. דרישה לבדיקת טענות ופרסומים כה רבים וכה מטרידים היא חובה המוטלת על מי שאמון על הליכי בחירה, ואין בה שום דבר הנוגע להכנעה. המשמעות של אמירתך זו היא כי בכל פעם שתועלה טענה ביחס למועמד מסוים, יוכל זה לטעון כי מדובר בניסיון להכניעו, ובכך תתייתר הבדיקה המעמיקה והמקצועית לגופן של הטענות. האם זוהי הנורמה החדשה שראוי לאמץ בהליכי מינויים בשירות הציבורי? ומדוע יש לאמץ נורמה חדשה זו דווקא עכשיו?".
מכתבו של עמית הגיע לאחר שלוין העביר אליו אמש מכתב שבו ציין, על רקע הפרסומים סביבו, כי "כלל הפרסומים, לו היו מתפרסמים ביחס למועמד למשרה ציבורית כלשהי, היו מחייבים באופן מיידי בדיקה מקיפה ומתן תשובות מלאות לוועדה הבוחרת ולציבור כולו טרם הבחירה. אין שום אפשרות שבחירה כלשהי הייתה מתבצעת טרם השלמת בדיקה כזו". לוין ביקש מעמית להשהות את מועמדותו - אך הוא כאמור הבהיר שוב כי מועמדותו בעינה עומדת, ושאין בכוונתו להשהותה. שר המשפטים פירט במכתבו את הפרסומים בעניינו של עמית - ובמכתב שהעביר אליו הנשיא המיועד הוא השיב לטענות לוין סעיף-סעיף.