ספינות של חיל הים לקחו חלק בירי שבוצע לעבר אזרחים עזתים בדרכם למרכזי חלוקת המזון של ה-GHF, ירי שמתואר בצה"ל כ"ירי הרחקה". הספינות ירו בתותחיהן לעבר קבוצות האזרחים שהתקדמו אל מרכזי החלוקה שלא במסגרת שעות פתיחתם.
האירועים האלה התרחשו בראשית חודש יוני. בצה"ל אישרו את המידע ואמרו כי הירי התבצע "פעמים בודדות", והדגישו כי לא כוון אל תוך מרכזי חלוקת המזון. בנוסף, אמרו כי לא נורו יריות בשעות שבהם המרכזים היו פתוחים והעזתים היו אמורים להגיע אליהם. בנוסף, טענו כאמור כי הירי היה להרחקה בלבד, ולא כוון לפגוע באזרחים.
ארגוני הסיוע בעזה, מנגד, מדווחים על מספרי מתים שנעים בין כ-100 ליותר מ-500 בעקבות ירי של צה"ל בסמוך למרכזי המזון בחודש האחרון. בעשרת הימים האחרונים הופסק כל ירי ארטילרי ברצועה להרחקת אזרחים בהוראת המפקדים, ובכלל זה ירי ספינות חיל הים.
