מנכ"ל משרד הביטחון, האלוף במיל' אמיר ברעם, כינס דיון בהשתתפות בכירי התעשיות הביטחוניות, שבו ציין כי לצד ההצלחה במלחמה עם איראן - זו יצרה גם "אתגרים מורכבים". "ההישג הצבאי יצר גם אתגרים מורכבים", אמר ברעם למנכ"לים של התעשייה האווירית, רפאל, אלביט מערכות ותומר. לדבריו, "אנחנו כבר מזהים את הניסיונות של איראן להשתקם ולצאת למאמץ בניין כוח חובק עולם".
בדיון הציגו בכירי משרד הביטחון לראשי התעשיות את תמונת המצב הביטחונית-מדינית ואת ההזדמנויות והאיומים החדשים שנוצרו "בראי הישגי המבצע". האלוף במיל' ברעם עדכן גם ב"סטטוס תוכנית ההצטיידות ובניין הכוח המגובשת בימים אלה". הוא ציין כי בשל מאמצי איראן להשתקם, "עלינו להיערך באותה תחושת דחיפות ולסכם תוכנית בניין כוח מואץ לשנה הקרובה ולעשור ביטחוני עצים. הזמן קצר ויקר".
ישראל מעריכה כי חלק ממלאי האורניום המועשר לרמה גבוהה של איראן - שנדרש ליצירת פצצה והוטמן מתחת לאדמה - שרד את התקיפות של ישראל ושל ארה"ב ב"מלחמת 12 הימים". כך דיווח העיתון "ניו יורק טיימס" מפי גורם ישראלי בכיר, שהוסיף כי ייתכן שהאורניום עלול להיות נגיש למדעני הגרעין באיראן.
מתקני הגרעין של איראן הופצצו תחילה על ידי ישראל במסגרת מבצע "עם כלביא" - חיל האוויר נמנע עם זאת מלהפציץ בעצמו את המתקן המבוצר ביותר בפורדו - ורק לקראת סיום המלחמה הצטרפה ארה"ב למתקפה עליהם והטילה, עם מפציצי B-2, פצצות חודרות בונקרים ענקיות על המתקן בפורדו וגם על מתקן העשרת האורניום בנתנז. ארה"ב שיגרה גם טילים מצוללות על המתקן באיספהאן, שבו היו מעבדות להמרת האורניום אחרי העשרתו מגז למתכת, שלב מרכזי בייצור נשק גרעיני.
מאז התקיפות הללו נותרו סימני שאלה גדולים סביב היקף הפגיעה בתוכנית הגרעין, כשנשיא ארה"ב דונלד טראמפ מתעקש שהמתקנים "הושמדו" לחלוטין וכשגם בישראל מצהירים שהיכולת של טהרן לפתח נשק גרעיני הוסגה אחרונית בכמה שנים. אף שלכל ברור כי מתקני הגרעין עצמם ספגו נזק אדיר - לפי הדיווח ב"ניו יורק טיימס", ההערכה הגוברת בארה"ב ובישראל היא שכל 18,000 הצנטריפוגות בנתנז ובפורדו הושמדו או ניזוקו מעבר ליכולת לתקנם - שאלה מרכזית נותרה סביב מאגר האורניום המועשר של איראן.
