יו"ר הוועדה המייעצת למינויים בכירים בשירות המדינה, נשיא בית המשפט העליון בדימוס אשר גרוניס, ימריא ביום ראשון לחופשה בחו"ל שממנה יחזור רק ב-20 ביוני. ואילו כהונתו של ראש השב"כ רונן בר מסתיימת ב-15 ביוני, אך בשל שהותו של גרוניס בחו"ל והיעדר חברים נוספים בוועדה - לא ניתן לאשר מינוי מחליף קבוע או זמני. המשמעות היא שככל הנראה תידרש הארכת כהונתו או מינוי ממלא מקום עד לחזרתו של גרוניס וכינוס הוועדה.
מאחורי הקלעים של הפער הזה מסתתר סבך בירוקרטי ומשפטי: היעדרותו של גרוניס מונעת את כינוס ועדת המינויים, ובמקביל חסרים בה שני חברים נוספים הדרושים להשלמת מניין חוקי. נציב שירות המדינה - תפקיד מרכזי בוועדה - לא קיים כלל, וגם נציגת הציבור טליה איינהורן אינה יכולה להשתתף בשל ניגוד עניינים, בשל מעורבות בנה ישראל בפרשת "קטאר-גייט".
בשלב זה, נראה שהממשלה תיאלץ למנות ממלא מקום לראש השב"כ עד לשובו של גרוניס ולכינוס הוועדה. אך גם זה לא פשוט: נתניהו ביקש למנות את מנכ"ל הרבנות הראשית יהודה כהן לממלא מקום נציב שירות המדינה – מינוי הכרחי לצורך מינוי ממלא מקום לראש השב"כ. אלא שהתברר כי נגד כהן מתנהלת חקירה משמעתית בנציבות, עקב תלונות שונות.
בשל החקירה, גיל לימון, המשנה ליועצת המשפטית לממשלה גלי בהרב-מיארה, הודיע לראש הממשלה כי נדרש להעמיק בבדיקת המינוי. ההערכה היא שהתשובה המשפטית תתקבל רק לאחר חג השבועות - ביום שלישי או רביעי. עד אז, לא ניתן יהיה למנות באופן חוקי ממלא מקום לראש השב"כ - ולא למנכ"ל משרד ראש הממשלה, שם הסתיימה כהונתה של ממלאת המקום דרורית שטיינמץ, וגם שם אין כיום מי שמכהן בתפקיד.
גורמים בסביבת נתניהו הדגישו כי היועצת המשפטית לממשלה ידעה מראש על נסיעתו של גרוניס לחו"ל. בסביבתו של כהן טוענים מנגד כי נעשה לו עוול. "תופרים לי תיק. ראיתי דברים הזויים ברבנות וביקשתי לעשות מהפכה - ואז הגיעו הטענות שאני מתעמר. פשוט אנשים לא באו לעבוד", אמר למקורביו.
לפי החוק, מינוי ממלא מקום לראש שב"כ מחייב התייעצות עם נציב שירות המדינה או מי שמכהן מטעמו. בהיעדר מינוי כזה, נבחנות כעת שתי אפשרויות נוספות: האחת - העברת הסמכויות לסגנו של בר, ש'; השנייה - מינוי שופט עליון אד-הוק שיכהן כיו"ר ועדת המינויים, בדומה לתקדים שנעשה עם השופט בדימוס אליקים רובינשטיין במינוי הרמטכ"ל הרצי הלוי.